Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rtf1A2AQ19 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rtf1A2AQ19 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rtf1A2AQ19 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.8 ms