Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Cln8Q9QUK3 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Cln8Q9QUK3 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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