Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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