Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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