Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vgll1Q99NC0 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vgll1Q99NC0 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vgll1Q99NC0 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vgll1Q99NC0 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vgll1Q99NC0 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vgll1Q99NC0 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vgll1Q99NC0 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vgll1Q99NC0 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Vgll1Q99NC0 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.6 ms