Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Usp38Q8BW70 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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Usp38Q8BW70 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Usp38Q8BW70 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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