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Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6
Syne1, Nesprin-1, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Syne1
Q6ZWR6
Gm26271-201
ENSMUST00000158349
104 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
AC124346.1-201
ENSMUST00000218539
364 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm22113-201
ENSMUST00000158343
104 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24306-201
ENSMUST00000180229
79 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm18185-201
ENSMUST00000186725
667 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
AC116465.1-201
ENSMUST00000220324
235 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
AC129208.2-201
ENSMUST00000228506
320 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23483-201
ENSMUST00000104179
108 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm27926-201
ENSMUST00000157180
66 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm26173-201
ENSMUST00000158416
136 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24321-201
ENSMUST00000175348
80 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm25131-201
ENSMUST00000082653
151 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm22572-201
ENSMUST00000082985
105 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23093-201
ENSMUST00000083450
102 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm15077-201
ENSMUST00000122344
362 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm22838-201
ENSMUST00000158437
99 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Vmn2r-ps20-201
ENSMUST00000179853
382 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23404-201
ENSMUST00000082543
97 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24707-201
ENSMUST00000082812
107 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm25518-201
ENSMUST00000083864
107 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Olfr1094-202
ENSMUST00000217509
1693 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm26018-201
ENSMUST00000104406
128 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm11116-201
ENSMUST00000113257
54 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Vmn2r-ps78-201
ENSMUST00000173350
308 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm26712-201
ENSMUST00000180813
217 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Olfr795-ps1-201
ENSMUST00000205245
763 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm45673-201
ENSMUST00000210293
358 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm19572-201
ENSMUST00000214326
338 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm22294-201
ENSMUST00000083308
104 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm25408-201
ENSMUST00000104104
133 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm2962-201
ENSMUST00000159266
336 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
AC153968.2-201
ENSMUST00000215579
1140 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm25650-201
ENSMUST00000083784
162 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm14400-201
ENSMUST00000117234
2135 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm14296-202
ENSMUST00000108931
750 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm14989-201
ENSMUST00000120497
207 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm11792-201
ENSMUST00000120640
168 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
2210418O10Rik-204
ENSMUST00000166464
750 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm25671-201
ENSMUST00000178612
105 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23307-201
ENSMUST00000179167
105 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm25286-201
ENSMUST00000179790
105 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
AC122905.2-201
ENSMUST00000220325
269 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm26135-201
ENSMUST00000101993
72 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm22016-201
ENSMUST00000158793
114 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Obox4-ps37-201
ENSMUST00000177223
276 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Snord50b-201
ENSMUST00000178497
72 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm37910-201
ENSMUST00000194770
217 nt
TSL 5
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm44954-201
ENSMUST00000208513
227 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24171-201
ENSMUST00000104126
131 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23421-201
ENSMUST00000158934
104 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Mir496b-201
ENSMUST00000184935
113 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Mir691-201
ENSMUST00000199719
78 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
AC159619.2-201
ENSMUST00000222924
401 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Snora75-201
ENSMUST00000082903
133 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm42718-201
ENSMUST00000197319
2681 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
n-R5s8-201
ENSMUST00000104121
118 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm12068-201
ENSMUST00000153153
376 nt
TSL 3
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24409-201
ENSMUST00000157881
152 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24843-201
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76 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm28579-201
ENSMUST00000186143
369 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm28196-201
ENSMUST00000187719
640 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm44464-201
ENSMUST00000198010
138 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Mir490-201
ENSMUST00000093567
84 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23981-201
ENSMUST00000157136
106 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23921-201
ENSMUST00000175258
107 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm27540-201
ENSMUST00000184950
187 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm20005-201
ENSMUST00000202583
299 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24043-201
ENSMUST00000083108
116 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm10801-201
ENSMUST00000099684
504 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm14287-201
ENSMUST00000121060
117 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm29013-201
ENSMUST00000187431
237 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm37330-201
ENSMUST00000192606
153 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm17906-201
ENSMUST00000202480
901 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm22283-201
ENSMUST00000082556
161 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm14803-201
ENSMUST00000117163
361 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Mir1899-201
ENSMUST00000122798
96 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24868-201
ENSMUST00000157265
136 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm25429-201
ENSMUST00000157607
132 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24077-201
ENSMUST00000158183
136 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm43993-201
ENSMUST00000203972
247 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
CT033781.2-201
ENSMUST00000221113
153 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24921-201
ENSMUST00000083024
107 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm25791-201
ENSMUST00000083292
137 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24116-201
ENSMUST00000103975
107 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm14773-201
ENSMUST00000125932
451 nt
TSL 2
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm25825-201
ENSMUST00000157091
124 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm26415-201
ENSMUST00000157673
292 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm22429-201
ENSMUST00000158553
130 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23002-201
ENSMUST00000179221
107 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Rpl23a-ps7-201
ENSMUST00000185437
460 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm44487-201
ENSMUST00000205145
325 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm44960-201
ENSMUST00000207403
141 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
n-R5s12-201
ENSMUST00000083785
119 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23013-201
ENSMUST00000104146
106 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23788-201
ENSMUST00000122535
106 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm24500-201
ENSMUST00000158447
124 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm22466-201
ENSMUST00000175278
69 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm25249-201
ENSMUST00000175471
78 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
AC156790.3-201
ENSMUST00000226200
254 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Syne1
Q6ZWR6
Gm23601-201
ENSMUST00000157259
131 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
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