Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Tpm4Q6IRU2 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Tpm4Q6IRU2 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Tpm4Q6IRU2 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms