Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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