Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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ptchd1Q14B62 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ptchd1Q14B62 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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ptchd1Q14B62 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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ptchd1Q14B62 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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ptchd1Q14B62 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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ptchd1Q14B62 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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ptchd1Q14B62 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ptchd1Q14B62 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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