Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RabggtbP53612 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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