Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
Rpl28P41105 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Rpl28P41105 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms