Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PtprmP28828 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PtprmP28828 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PtprmP28828 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PtprmP28828 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PtprmP28828 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PtprmP28828 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PtprmP28828 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PtprmP28828 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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