Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd12P23812 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Hoxd12P23812 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.4 ms