Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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Nedd9O35177 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Nedd9O35177 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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