Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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Zfp558E9Q1J0 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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Zfp558E9Q1J0 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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Zfp558E9Q1J0 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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Zfp558E9Q1J0 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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Zfp558E9Q1J0 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Zfp558E9Q1J0 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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