Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Spocd1B1ASB6 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Spocd1B1ASB6 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms