Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cln8Q9QUK3 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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