Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Rabgef1Q9JM13 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rabgef1Q9JM13 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms