Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtaQ9JHK4 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtaQ9JHK4 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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