Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc39Q9D5Y1 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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