Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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