Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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PtprtQ99M80 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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PtprtQ99M80 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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PtprtQ99M80 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprtQ99M80 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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PtprtQ99M80 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
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PtprtQ99M80 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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PtprtQ99M80 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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PtprtQ99M80 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
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PtprtQ99M80 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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PtprtQ99M80 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprtQ99M80 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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