Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
Smim11aQ99J19 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC-2.41□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC-2.45□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
Smim11aQ99J19 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC-2.51□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC-2.51□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC-2.53□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
Smim11aQ99J19 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC-2.56□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm24336-201ENSMUST00000104203 146 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
Smim11aQ99J19 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms