Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn16Q925N4 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.3 ms