Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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Usp38Q8BW70 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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Usp38Q8BW70 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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Usp38Q8BW70 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Usp38Q8BW70 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Usp38Q8BW70 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Usp38Q8BW70 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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Usp38Q8BW70 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Usp38Q8BW70 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Usp38Q8BW70 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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