Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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Syne1Q6ZWR6 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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Syne1Q6ZWR6 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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Syne1Q6ZWR6 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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Syne1Q6ZWR6 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Syne1Q6ZWR6 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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