Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm44351-201ENSMUST00000200090 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC-0.81□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22183-201ENSMUST00000175420 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir297b-201ENSMUST00000102268 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC-0.85□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
NipblQ6KCD5 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
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