Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Sft2d1Q5SSN7 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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