Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Trim71Q1PSW8 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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