Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ptchd1Q14B62 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ptchd1Q14B62 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.3 ms