Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Hoxd1Q01822 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd1Q01822 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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