Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RabggtbP53612 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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