Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VdrP48281 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VdrP48281 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VdrP48281 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VdrP48281 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VdrP48281 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VdrP48281 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VdrP48281 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VdrP48281 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VdrP48281 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VdrP48281 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VdrP48281 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VdrP48281 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
VdrP48281 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VdrP48281 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VdrP48281 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VdrP48281 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VdrP48281 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VdrP48281 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VdrP48281 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VdrP48281 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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