Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RxraP28700 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RxraP28700 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RxraP28700 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RxraP28700 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RxraP28700 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RxraP28700 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RxraP28700 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RxraP28700 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RxraP28700 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RxraP28700 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RxraP28700 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RxraP28700 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RxraP28700 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
RxraP28700 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RxraP28700 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RxraP28700 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RxraP28700 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RxraP28700 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RxraP28700 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RxraP28700 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RxraP28700 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RxraP28700 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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