Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Vpreb1P13372 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Vpreb1P13372 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.2 ms