Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nedd9O35177 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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