Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MttpO08601 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MttpO08601 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MttpO08601 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MttpO08601 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MttpO08601 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MttpO08601 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
MttpO08601 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
MttpO08601 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MttpO08601 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MttpO08601 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MttpO08601 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MttpO08601 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MttpO08601 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MttpO08601 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MttpO08601 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MttpO08601 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MttpO08601 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
MttpO08601 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MttpO08601 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MttpO08601 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
MttpO08601 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MttpO08601 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms