Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NebE9Q1W3 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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