Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
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Zfp558E9Q1J0 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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Zfp558E9Q1J0 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
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Zfp558E9Q1J0 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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Zfp558E9Q1J0 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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Zfp558E9Q1J0 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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Zfp558E9Q1J0 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
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Zfp558E9Q1J0 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zfp558E9Q1J0 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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