Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc9bA3KGF9 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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