Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cln8Q9QUK3 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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