Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtaQ9JHK4 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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