Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp29Q9ES63 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp29Q9ES63 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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