Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Ccdc47Q9D024 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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