Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
Atg3Q9CPX6 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Atg3Q9CPX6 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms