Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu1Q99J10 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu1Q99J10 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ctu1Q99J10 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ctu1Q99J10 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ctu1Q99J10 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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