Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn16Q925N4 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn16Q925N4 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.2 ms