Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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Usp38Q8BW70 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Usp38Q8BW70 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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