Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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